Index

A

A1M1() (FitPara.RDC method) A1M2() (FitPara.RDC method) A1MN() (FitPara.RDC method) A2M1() (FitPara.RDC method) ABGFromRotMatrixZXZ() (in module ParaUtils) ABGFromRotMatrixZYZ() (in module ParaUtils) addElement() (ParaParser.ParaParser method) (ParaParser.PCSParser method) (ParaParser.PREParser method) (ParaParser.RDCParser method)

addErrorFlatCoords() (ParaParser.ParaParser method) (ParaParser.PCSParser method) (ParaParser.PREParser method) (ParaParser.RDCParser method) addErrorFlatMeas() (ParaParser.ParaParser method) (ParaParser.PCSParser method) (ParaParser.PREParser method) (ParaParser.RDCParser method) addErrorGaussCoords() (ParaParser.ParaParser method) (ParaParser.PCSParser method) (ParaParser.PREParser method) (ParaParser.RDCParser method) addErrorGaussianMeas() (ParaParser.ParaParser method) (ParaParser.PCSParser method) (ParaParser.PREParser method) (ParaParser.RDCParser method) AnglesUTR() (FitPara.ParaEffectAdv method) (FitPara.PCS method) (FitPara.RDC method) AXM1() (FitPara.RDC method)

C

C1M1() (FitPara.PRE method) C1M1OC() (FitPara.PRE method) C1M2() (FitPara.PRE method) C1M2OC() (FitPara.PRE method) C1MN() (FitPara.PRE method) C1MNOC() (FitPara.PRE method) C2M1() (FitPara.PRE method) C2M1FM1() (FitPara.PRE method)

C2M1FM1OC() (FitPara.PRE method) C2M1OC() (FitPara.PRE method) calc() (CalcPara.PCS method) (CalcPara.PRE method) (CalcPara.RDC method) CalcPara (module) correctAngle() (in module ParaUtils) CXM1() (FitPara.PRE method) CXM1OC() (FitPara.PRE method)

D

doParse() (ParaParser.PCSParser method) (ParaParser.PREParser method) (ParaParser.RDCParser method)

E

ExplorePara (module)

F

FitPara (module) FitQ() (FitPara.ParaEffect method) (FitPara.PCS method) (FitPara.PRE method) (FitPara.RDC method)

FixAngle() (in module ParaUtils) FromVVU() (in module ParaUtils)

G

getAllMeasarray() (ParaParser.ParaParser method) (ParaParser.PCSParser method) (ParaParser.PREParser method) (ParaParser.RDCParser method) getAllTolarray() (ParaParser.ParaParser method) (ParaParser.PCSParser method) (ParaParser.PREParser method) (ParaParser.RDCParser method) getAllXarray() (ParaParser.ParaParser method) (ParaParser.PCSParser method) (ParaParser.PREParser method) (ParaParser.RDCParser method) getAllYarray() (ParaParser.ParaParser method) (ParaParser.PCSParser method) (ParaParser.PREParser method) (ParaParser.RDCParser method) getAllZarray() (ParaParser.ParaParser method) (ParaParser.PCSParser method) (ParaParser.PREParser method) (ParaParser.RDCParser method) getAlpha() (ParaParser.PCSParser method) (ParaParser.RDCParser method) getAxial() (ParaParser.PCSParser method) (ParaParser.RDCParser method) getAxialVVU() (ParaParser.PCSParser method) getB0() (ParaParser.RDCParser method) getBeta() (ParaParser.PCSParser method) (ParaParser.RDCParser method) getConstant() (ParaParser.PREParser method) getConv() (CalcPara.PCS method) (CalcPara.RDC method) getCoord() (ParaData.ParaData method) (ParaData.PCSData method) (ParaData.PREData method) (ParaData.RDCData method) getCoordx() (ParaData.ParaData method) (ParaData.PCSData method) (ParaData.PREData method) (ParaData.RDCData method) getCoordy() (ParaData.ParaData method) (ParaData.PCSData method) (ParaData.PREData method) (ParaData.RDCData method) getCoordz() (ParaData.ParaData method) (ParaData.PCSData method) (ParaData.PREData method) (ParaData.RDCData method) getCVal() (ParaData.ParaData method) (ParaData.PCSData method) (ParaData.PREData method) (ParaData.RDCData method) getDataset() (ParaParser.ParaParser method) (ParaParser.PCSParser method) (ParaParser.PREParser method) (ParaParser.RDCParser method) getDataType() (ParaParser.ParaParser method) (ParaParser.PCSParser method) (ParaParser.PREParser method) (ParaParser.RDCParser method) getEType() (CalcPara.RDC method) getGamma() (ParaParser.PCSParser method) (ParaParser.RDCParser method) getId() (ParaData.ParaData method) (ParaData.PCSData method) (ParaData.PREData method) (ParaData.RDCData method) getMetalLoc() (ParaParser.PCSParser method) (ParaParser.PREParser method) getMetalLocx() (ParaParser.PCSParser method) (ParaParser.PREParser method)

getMetalLocy() (ParaParser.PCSParser method) (ParaParser.PREParser method) getMetalLocz() (ParaParser.PCSParser method) (ParaParser.PREParser method) getName() (ParaData.ParaData method) (ParaData.PCSData method) (ParaData.PREData method) (ParaData.RDCData method) getNLabel() (CalcPara.RDC method) getNumModels() (ParaParser.ParaParser method) (ParaParser.PCSParser method) (ParaParser.PREParser method) (ParaParser.RDCParser method) getOrder() (ParaParser.RDCParser method) getParaDataFn() (ParaParser.ParaParser method) (ParaParser.PCSParser method) (ParaParser.PREParser method) (ParaParser.RDCParser method) getParams() (FitPara.PCS method) (FitPara.PRE method) (FitPara.RDC method) getParsed() (ParaParser.ParaParser method) (ParaParser.PCSParser method) (ParaParser.PREParser method) (ParaParser.RDCParser method) getPDBFn() (ParaParser.ParaParser method) (ParaParser.PCSParser method) (ParaParser.PREParser method) (ParaParser.RDCParser method) getpObj() (CalcPara.PCS method) (CalcPara.PRE method) (CalcPara.RDC method) getpObjL() (CalcPara.PCS method) (CalcPara.PRE method) (CalcPara.RDC method) getRhombic() (ParaParser.PCSParser method) (ParaParser.RDCParser method) getRhombicVVU() (ParaParser.PCSParser method) getSiteParams() (ParaParser.PREParser method) getSiteParamsNice() (ParaParser.PREParser method) getStructure() (ParaParser.ParaParser method) (ParaParser.PCSParser method) (ParaParser.PREParser method) (ParaParser.RDCParser method) getTemp() (ParaParser.RDCParser method) getTensorParams() (ParaParser.PCSParser method) (ParaParser.RDCParser method) getTensorParamsNice() (ParaParser.PCSParser method) (ParaParser.RDCParser method) getTol() (ParaData.ParaData method) (ParaData.PCSData method) (ParaData.PREData method) (ParaData.RDCData method) getType() (ParaData.ParaData method) (ParaData.PCSData method) (ParaData.PREData method) (ParaData.RDCData method) getUseFit() (ParaData.ParaData method) (ParaData.PCSData method) (ParaData.PREData method) (ParaData.RDCData method) getVal() (ParaData.ParaData method) (ParaData.PCSData method) (ParaData.PREData method) (ParaData.RDCData method)

L

loadSession() (in module ParaUtils)

lookupMGR() (in module ParaUtils)

O

opts() (ExplorePara.ParaData method) (FitPara.PCS method) (FitPara.PRE method) (FitPara.RDC method)

P

ParaData (class in ExplorePara) (class in ParaData) (module) ParaEffect (class in FitPara) ParaEffectAdv (class in FitPara) ParaParser (class in ParaParser) (module) paraSummary() (ExplorePara.ParaData method) ParaUtils (module) parsingErrorMSG() (ParaParser.ParaParser method) (ParaParser.PCSParser method) (ParaParser.PREParser method) (ParaParser.RDCParser method)

PCS (class in CalcPara) (class in FitPara) PCSData (class in ParaData) PCSParser (class in ParaParser) PRE (class in CalcPara) (class in FitPara) PREData (class in ParaData) PREParser (class in ParaParser) printParams() (FitPara.PCS method) (FitPara.PRE method) (FitPara.RDC method)

R

randomRemoveElements() (ParaParser.ParaParser method) (ParaParser.PCSParser method) (ParaParser.PREParser method) (ParaParser.RDCParser method) RDC (class in CalcPara) (class in FitPara) RDCData (class in ParaData) RDCParser (class in ParaParser) rdcScal() (in module ParaUtils)

reloadParaData() (ParaParser.ParaParser method) (ParaParser.PCSParser method) (ParaParser.PREParser method) (ParaParser.RDCParser method) removeElement() (ParaParser.ParaParser method) (ParaParser.PCSParser method) (ParaParser.PREParser method) (ParaParser.RDCParser method) RotX90() (in module ParaUtils) RotY90() (in module ParaUtils) RotZ90() (in module ParaUtils)

S

saveSession() (ParaParser.ParaParser method) (ParaParser.PCSParser method) (ParaParser.PREParser method) (ParaParser.RDCParser method) setAlpha() (ParaParser.PCSParser method) (ParaParser.RDCParser method) setAxial() (ParaParser.PCSParser method) (ParaParser.RDCParser method) setB0() (ParaParser.RDCParser method) setBeta() (ParaParser.PCSParser method) (ParaParser.RDCParser method) setCalcedToObs() (ParaParser.ParaParser method) (ParaParser.PCSParser method) (ParaParser.PREParser method) (ParaParser.RDCParser method) setConstant() (ParaParser.PREParser method) setConv() (CalcPara.PCS method) (CalcPara.RDC method) setCoord() (ParaData.ParaData method) (ParaData.PCSData method) (ParaData.PREData method) (ParaData.RDCData method) setCoord2() (ParaData.RDCData method) setCoord2x() (ParaData.RDCData method) setCoord2y() (ParaData.RDCData method) setCoord2z() (ParaData.RDCData method) setCoordx() (ParaData.ParaData method) (ParaData.PCSData method) (ParaData.PREData method) (ParaData.RDCData method) setCoordy() (ParaData.ParaData method) (ParaData.PCSData method) (ParaData.PREData method) (ParaData.RDCData method) setCoordz() (ParaData.ParaData method) (ParaData.PCSData method) (ParaData.PREData method) (ParaData.RDCData method) setCVal() (ParaData.ParaData method) (ParaData.PCSData method) (ParaData.PREData method) (ParaData.RDCData method) setEType() (CalcPara.RDC method) setGamma() (ParaParser.PCSParser method) (ParaParser.RDCParser method) setId() (ParaData.ParaData method) (ParaData.PCSData method) (ParaData.PREData method) (ParaData.RDCData method) setMetalLoc() (ParaParser.PCSParser method) (ParaParser.PREParser method)

setMetalLocx() (ParaParser.PCSParser method) (ParaParser.PREParser method) setMetalLocy() (ParaParser.PCSParser method) (ParaParser.PREParser method) setMetalLocz() (ParaParser.PCSParser method) (ParaParser.PREParser method) setModel() (ParaParser.ParaParser method) (ParaParser.PCSParser method) (ParaParser.PREParser method) (ParaParser.RDCParser method) setName() (ParaData.ParaData method) (ParaData.PCSData method) (ParaData.PREData method) (ParaData.RDCData method) setName2() (ParaData.RDCData method) setNLabel() (CalcPara.RDC method) setOrder() (ParaParser.RDCParser method) setParaDataFn() (ParaParser.ParaParser method) (ParaParser.PCSParser method) (ParaParser.PREParser method) (ParaParser.RDCParser method) setPDBFn() (ParaParser.ParaParser method) (ParaParser.PCSParser method) (ParaParser.PREParser method) (ParaParser.RDCParser method) setpObj() (CalcPara.PCS method) (CalcPara.PRE method) (CalcPara.RDC method) setpObjL() (CalcPara.PCS method) (CalcPara.PRE method) (CalcPara.RDC method) setRhombic() (ParaParser.PCSParser method) (ParaParser.RDCParser method) setSiteParam() (ParaParser.PREParser method) setTemp() (ParaParser.RDCParser method) setTensorParam() (ParaParser.PCSParser method) setTensorParams() (ParaParser.RDCParser method) setTol() (ParaData.ParaData method) (ParaData.PCSData method) (ParaData.PREData method) (ParaData.RDCData method) setUseFit() (ParaData.ParaData method) (ParaData.PCSData method) (ParaData.PREData method) (ParaData.RDCData method) setVal() (ParaData.ParaData method) (ParaData.PCSData method) (ParaData.PREData method) (ParaData.RDCData method)

T

T1M1() (FitPara.PCS method) T1M1FM() (FitPara.PCS method) T1M2() (FitPara.PCS method) T1M2FM() (FitPara.PCS method) T1MN() (FitPara.PCS method) T1MNFM() (FitPara.PCS method)

T2M1() (FitPara.PCS method) T2M1FM1() (FitPara.PCS method) T2M1FM1FM2() (FitPara.PCS method) TNM1CM() (FitPara.PCS method) ToVVU() (in module ParaUtils) TXM1() (FitPara.PCS method)

U

updateFromFit() (FitPara.PCS method) (FitPara.PRE method) (FitPara.RDC method)

W

writeDataSetNumbat() (ParaParser.ParaParser method) (ParaParser.PCSParser method) (ParaParser.PREParser method) (ParaParser.RDCParser method)

Z

ZXZRot() (in module ParaUtils)

ZYZRot() (in module ParaUtils)